Ngành Thuế đang đẩy mạnh ứng dụng công nghệ và dữ liệu trong công tác quản lý thuế, trong đó có việc tự động hóa quy trình hoàn thuế giá trị gia tăng. Theo thông tin được công bố, hệ thống hoàn thuế GTGT tự động dự kiến được đưa vào vận hành từ tháng 10/2026.

Việc triển khai hệ thống mới được kỳ vọng giúp quá trình tiếp nhận, phân tích và xử lý hồ sơ hoàn thuế được thực hiện nhanh chóng, minh bạch hơn, qua đó hỗ trợ doanh nghiệp sớm thu hồi dòng tiền để phục vụ hoạt động sản xuất kinh doanh.

Tuy nhiên, doanh nghiệp cần hiểu đúng về khái niệm hoàn thuế GTGT tự động. Đây không phải là việc doanh nghiệp không cần lập hồ sơ hoặc cứ phát sinh số thuế GTGT đầu vào là được tự động hoàn thuế.

1.Hoàn thuế GTGT tự động được hiểu như thế nào?

Theo định hướng triển khai, hệ thống sẽ tăng cường sử dụng dữ liệu điện tử để đối chiếu thông tin, phân tích hồ sơ và đánh giá mức độ rủi ro. Các dữ liệu liên quan đến hóa đơn điện tử, kê khai thuế, thông tin giao dịch và lịch sử tuân thủ của doanh nghiệp có thể được sử dụng trong quá trình đánh giá hồ sơ.

Việc tự động hóa giúp giảm bớt các khâu xử lý thủ công, đồng thời hỗ trợ cơ quan thuế phân loại hồ sơ theo mức độ rủi ro để xác định phương thức xử lý phù hợp.

Doanh nghiệp vẫn phải thực hiện kê khai, lập hồ sơ đề nghị hoàn thuế và đáp ứng đầy đủ các điều kiện hoàn thuế theo quy định hiện hành.

Theo số liệu được công bố, đến ngày 21/9/2026, khoảng 99% hồ sơ hoàn thuế GTGT đã được thực hiện bằng phương thức điện tử. Trong số các quyết định hoàn thuế đã được ban hành, khoảng 73% thuộc diện hoàn trước, kiểm tra sau.

Những số liệu này cho thấy quy trình hoàn thuế đã được số hóa ở mức cao. Việc tiếp tục triển khai hệ thống tự động được xem là bước phát triển tiếp theo trong quá trình hiện đại hóa quản lý hoàn thuế.

2.Doanh nghiệp cần chuẩn bị gì khi hoàn thuế được tự động hóa?

Khi việc xử lý hồ sơ ngày càng dựa nhiều hơn vào dữ liệu điện tử, doanh nghiệp cần đặc biệt chú ý đến tính chính xác và nhất quán của hồ sơ.

Trước hết, doanh nghiệp cần kiểm tra hóa đơn GTGT đầu vào. Thông tin trên hóa đơn cần phù hợp với giao dịch thực tế, hàng hóa hoặc dịch vụ phát sinh và số liệu được kê khai.

Bên cạnh đó, chứng từ thanh toán cần được lưu trữ đầy đủ và đáp ứng các điều kiện theo quy định đối với từng trường hợp hoàn thuế. Các hồ sơ liên quan đến giao dịch như hợp đồng, biên bản giao nhận, chứng từ nhập xuất và hồ sơ thanh toán cũng cần được quản lý đầy đủ để có cơ sở chứng minh giao dịch thực tế khi cần thiết.

Doanh nghiệp cũng nên thường xuyên đối chiếu số liệu giữa hóa đơn điện tử, sổ sách kế toán và tờ khai thuế. Những chênh lệch về số liệu hoặc thông tin giữa các nguồn dữ liệu có thể khiến hồ sơ cần được rà soát thêm.

Một vấn đề khác cần được doanh nghiệp lưu ý là dữ liệu liên quan đến nhà cung cấp và chuỗi giao dịch. Cơ quan thuế đang tăng cường sử dụng dữ liệu để nhận diện các trường hợp có dấu hiệu rủi ro. Tuy nhiên, việc xuất hiện cảnh báo rủi ro không đồng nghĩa với việc doanh nghiệp đương nhiên bị từ chối hoàn thuế. Hồ sơ vẫn cần được xem xét dựa trên các điều kiện và quy định có liên quan.

3.Hoàn thuế tự động không đồng nghĩa với tự động được hoàn thuế

Điểm doanh nghiệp cần ghi nhớ là tự động hóa quy trình không làm thay đổi nguyên tắc doanh nghiệp phải đáp ứng điều kiện hoàn thuế.

Hệ thống tự động có thể hỗ trợ cơ quan thuế trong việc tiếp nhận dữ liệu, đối chiếu thông tin và phân loại rủi ro, nhưng doanh nghiệp vẫn phải chịu trách nhiệm về tính chính xác, đầy đủ và hợp pháp của hồ sơ đề nghị hoàn thuế.

Do đó, doanh nghiệp có số thuế GTGT dự kiến đề nghị hoàn nên chủ động rà soát hồ sơ ngay từ quá trình kê khai, thay vì chỉ kiểm tra khi chuẩn bị nộp hồ sơ hoàn thuế.

Việc chuẩn hóa chứng từ, kiểm soát hóa đơn đầu vào và đối chiếu số liệu thường xuyên sẽ giúp doanh nghiệp chủ động hơn khi thực hiện hoàn thuế, đồng thời hạn chế những sai sót có thể phát sinh trong quá trình xử lý hồ sơ.

Thông tin liên hệ

CÔNG TY TNHH KẾ TOÁN VÀ TƯ VẤN KH (KIẾN HƯNG)

Địa chỉ: 33 Phan Văn Khỏe, Phường Chợ Lớn, TP.HCM

Hotline: 0978 619 629

Website: www.ketoankh.com

Email: admin@ketoankh.com

Zalo OA: https://zalo.me/2762638483354012481